При построении селекционных программ учитывают целевое задание (выведение столовых, кишмишных, технических, подвойных сортов винограда); особенности эволюции винограда в первичных и вторичных центрах происхождения; ботанико-географические данные; генетические закономерности и наследственную изменчивость видов, экотипов, сортов, гибридных популяций.
Основу селекции растений составляет подбор пар и скрещивание лучших по фено- и генотипу родительских форм, взаимно дополняющих друг друга недостающими признаками при минимальном проявлении отрицательных свойств, с последующим отбором особей, максимально соответствующих селекционной задаче по комплексу хозяйственно-ценных и биологически ценных показателей.
Предпочтение отдают формам, генетически и эколого-географически отдаленным, с контрастными признаками, так как в этом случае расширяется спектр рекомбинаций и обеспечивается наиболее полное выщепление ценных гибридов.
Главные трудности селекции винограда заключаются не в том, чтобы получить гибрид с высокой устойчивостью к тому или иному агенту или даже к их группе, а в том, чтобы сочетать в едином организме комплекс факторов устойчивости с требуемыми от сорта внешними и диетическими свойствами гроздей и ягод.
В селекцию на устойчивость и высокую приспособляемость вовлекается не только огромное сортовое разнообразие В. винифера, но и богатый естественный генофонд. Гетерогенность диких видов винограда, распространенных в центрах происхождения винограда - европейско-азиатском, восточно-азиатском и североамериканском,- еще недостаточно изучена, поэтому поиск форм для непосредственного окультуривания или включения в селекционный процесс продолжается.
Особую ценность представляют источники группового иммунитета к основным болезням и насекомым. К ним относится ряд американских видов и гибридных форм винограда, полученных с их участием. Среди них большой интерес представляет тропический виноград В. ротундифолиа, комплексно иммунный к филлоксере, нематодам, милдью, оидиуму, антракнозу, серой гнили. Наличие в природе таких видов подтверждает, что выведение сортов с групповой устойчивостью - вполне реальная задача.
Из прочих американских видов винограда донорами достаточно высокой комплексной устойчивости считаются В. цинереа Арнольди, В. кардифолиа, В. солонис, В. монтикола, В. берландиери, В. рипариа, В. рупестрис.
Экотипы дикого амурского винограда В. амурензис являются донорами высокой морозоустойчивости, раннеспелости, способности к высокому сахаронакоплению, а некоторые из них также и устойчивости к милдью.
В роли источников высокой урожайности и отличных вкусовых качеств ягод используются представители разных эколого-географических групп европейско-азиатского винограда В. винифера. Для выведения винных сортов наиболее перспективна западноевропейская эколого-географическая группа, прежде всего сорта винограда французского и немецкого происхождения с повышенной зимостойкостью (группа Пино, Каберне Совиньон, Мерло, Траминер, Сильванер, Рислинг и др.). В этих же целях могут быть привлечены для скрещиваний и сорта эколого-географической группы бассейна Черного моря, в частности, представители грузинской подгруппы, относительно морозостойкие, устойчивые к серой гнили ягод и филлоксере (Ркацители, Мцване, Александроули, Купрашвили сеули и др.). Благодаря наличию мускатного аромата весьма ценятся технические сорта винограда восточной эколого-географической группы из Западной Азии, подгруппы каспика (Мускат белый, Мускат розовый и др.).
Общепризнанными донорами лучших признаков столового винограда - крупногроздности и крупноягодности, плотной консистенции ягод, вкусовых качеств, привлекательной окраски - также являются сорта восточной эколого-географической группы, подгруппы антазиатика (Мускат александрийский, Тайфи розовый, Султани, Карабурну, Риш баба, Катта-Курган, Хусайне и др.). Кишмишные сорта винограда этой подгруппы (Кишмиш белый, розовый, черный и др.) - носители генов бессемянности. Их используют при выведении бессемянных столовых сортов для потребления в свежем и сушеном виде.
Экспериментальная работа по иммуноселекции продолжается в мире более ста лет, и за этот период было создано множество отдаленных гибридов разных поколений и разного происхождения америко-американских, амуро-американских, европейско-американских, европейско-амуро-американских и т. д. Многие из них уже были взяты как родительские формы и дали потомство, превосходящее чистые виды по селекционной и практической ценности. Таковы, например, сложные гибриды винограда, выведенные во Франции Бако, Раватом, Сейвом, Зейбелем, Сейв Вилларом: СВ 12-375, СВ 5-276, СВ 23-657, СВ 18-315, СВ 12-48, Зейбель 7-053, Зейбель 13-666, СВ 20-473 (Мускат де Сен-Валье), СВ 20-365 (Датье де Сен-Валье), СВ 20-366 (Пьеррелль) и др.
С участием этих гибридов получены многие новые немецкие сорта - ГМ 346-67, ГМ 347-67, ГМ 348-67, венгерские - Зала дендье, Пелюшка мушкотай, Лакхедьи Мезеш, молдавские - Молдова, Страшенский, Ляна, Декабрьский, украинские - Ланка, Оригинал, Смена, Таир, Рубин таировский, Антей магарачский и другие сорта винограда с групповой устойчивостью к милдью, оидиуму, сравнительно морозоустойчивые, а некоторые из них устойчивые к филлоксере.
Наиболее эффективным путем создания новых устойчивых сортов винограда остается продолжение селекционной работы, начатой предыдущими поколениями селекционеров и иммунологов, и подбор в качестве исходных родителей новых сортов с обогащенным генотипом как представителей культурного европейско-азиатского винограда, так и сложных многовидовых форм с групповой устойчивостью к тем или иным неблагоприятным факторам среды и патогенам. Причем предпочтительно включать в селекцию не сорта-популяции, а лучшие клоны аборигенных и новых сортов винограда.
Эмпирические методы подбора пар и проведение гибридологического анализа могут быть дополнены применением развивающегося нового метода - анализа изоэнзимных и других белковых систем родительских форм с помощью электрофореза. Этот способ после окончательной доработки может позволить классифицировать растения и проводить генетический анализ больших популяций на стадии сеянцев и таким путем существенно повысить эффективность селекционного процесса винограда.